MKRed（效果同GelRed）核酸染料（10,000× 水溶液）

MKRed核酸凝膠染料特點

● 無毒性：MKRed *的油性和大分子量特點使其不能穿透細(xì)胞膜進入細(xì)胞內(nèi)，艾姆斯氏試驗結(jié)果也表明，該染料的誘變性遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于EB。

● 靈敏度高：適用于各種大小片段的電泳染色，對核酸遷移的影響小于SYBR Green I。

● 穩(wěn)定性高： 適用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠；室溫下在酸或堿緩沖液中極其穩(wěn)定，耐光性強。

● 信噪比高：樣品熒光信號強，背景信號低。

● 操作簡單：與 EB 一樣，在預(yù)制膠和電泳過程中染料不降解；而電泳后染色過程也只需30 分鐘且無需脫色或沖洗 ，即可直接用紫外凝膠透射儀觀察。

● 與EB有相同的光譜特性，無需改變?yōu)V光片及觀察裝置：標(biāo)準(zhǔn)的 EB 濾光片或 SYBR 濾光片都適用，使用與觀察EB相同的普通紫外凝膠透射儀觀察即可，在 300nm 紫外光附近可得到zui好激發(fā)。但是MKRed不能被488 nm氬離子激光器或相似波長的可見光*激發(fā)，因此不推薦使用此類激發(fā)裝置的成像系統(tǒng)。對于此類裝置，我們推薦您使用DuGreen（Cat# 011或012），它和SYBR Green I的光譜相似，靈敏度相當(dāng)，但更加穩(wěn)定。

核酸凝膠染料使用方法簡介

1．膠染法（用法同EB）（推薦方法）

（1） 制膠時加入MKRed 核酸染料（例如：每50mL 瓊脂糖溶液中加入5μL MKRed 10,000× 儲液，

以此比例類推）。

（2） 按照常規(guī)方法進行電泳。

注意事項：

♦ 此方法染色染料用量相對較少。500 μL染料大約可以做100塊 50mL的膠。

♦ 由于MKRed具有良好的熱穩(wěn)定性，可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加，而不需要等待溶液冷卻。搖晃，振蕩或者翻轉(zhuǎn)以保證染料充分混勻。也可以選擇將MKRed儲液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中，然后用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。MKRed兼容所有常用的電泳緩沖溶液。

♦ 如果總是看到條帶彌散或分離不理想，建議使用泡染法染色以確認(rèn)問題是否與染料有關(guān)。如果染色后問題依舊存在，則說明問題與染料無關(guān)，請嘗試：降低瓊脂糖濃度；選用更長的凝膠；延長凝膠時間以保證邊緣清晰；改進上樣技巧或選擇泡染法染色。

♦ 此方法不適合預(yù)制聚丙烯酰胺凝膠，對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。

2．泡染法

（1） 按照常規(guī)方法進行電泳。

（2） 用H2O將MKRed 10,000× 儲液稀釋約3,300倍到0.1M NaCl中，制成3× 染色液。（例如將15μL MKRed 10,000× 儲液和5mL 1M NaCl加到45mL H2O中）。

（3） 將凝膠小心地放入合適的容器中，如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的3× 染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右，zui合適染色時間根據(jù)凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對于含3.5～10％丙烯酰胺的凝膠，染色時間通常介于30min到1h，并隨丙烯酰胺含量增加而延長。

注意事項：

♦ 用泡染法染色時，染料用量較多。單次使用的染色液可重復(fù)使用3次左右。

♦ 3× MKRed染色液可以大量制備，在室溫下避光保存直至用完。

幾種核酸染料比較

特別提醒：

♦ 如果您使用的是紫外成像儀，請選擇MKRed；如果您使用激光成像儀或希望在可見光下觀測，請選擇 MKGreen。

♦ 在極少數(shù)情況下，質(zhì)粒經(jīng)某些酶切后的DNA樣品會出現(xiàn)拖尾和分辨率降低，此時建議同時嘗試兩種染色方法以決定哪種方法更加合適。

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